Protéger les vergers et soutenir la filière fruitière
La Chaire Sharka est dédiée à la lutte contre la maladie virale de la sharka, une pathologie qui affecte gravement les arbres fruitiers à noyaux (pêchers, abricotiers, pruniers). Elle mène des recherches pour développer des outils innovants de détection précoce, de prévention et de gestion durable de cette maladie.
Grâce à une collaboration étroite avec les agriculteurs et les acteurs du secteur, elle contribue à protéger les vergers et à soutenir la filière fruitière face à ce défi majeur.
En s’appuyant sur l’expertise de Cédric BERTRAND, Professeur Enseignant-chercheur à l’UPVD, et sur la forte implication des producteurs et de la FDGDON 66, les expérimentations et analyses de la chaire se développent.
La sharka dans les Pyrénées-Orientales : quelques chiffres clés
- 30,8 % des surfaces en pêches et nectarines
- 60 000 pieds arrachés par an
- 80 % des contaminations nationales sont concentrées dans le département
- 240 variétés d’arbres impactées
Actualités
Bilan synthétique des actions 2025 sur la sharka
Résultats et perspectives
Contexte La sharka, maladie virale causée par le Plum pox virus (PPV), touche particulièrement les Pyrénées-Orientales, où elle concentre 74 % des infections nationales et engendre des pertes économiques majeures (1,6 M€ en 2021). En 2025, trois stagiaires de master ont mené des travaux innovants pour améliorer la détection et la gestion de cette maladie grâce à l’analyse métabolomique.
Travaux réalisés par les stagiaires
- Faustine Lefort (M2 CEEC) : Création d’une « méga-matrice » de métadonnées, compilant et valorisant 1 765 fichiers d’analyses métabolomiques de feuilles de prunus (2022-2024). Cet outil permet désormais d’exploiter pleinement les données brutes pour identifier des marqueurs spécifiques de la maladie.
- Destan Deygas : Évaluation de l’analyse métabolomique des racines et des feuilles pour un diagnostic précoce. Les résultats montrent que l’analyse foliaire permet de discriminer efficacement les arbres sains des arbres infectés, en conditions contrôlées comme en verger, tandis que l’analyse racinaire ne s’avère pas concluante.
- Chloé Walker : Caractérisation de l’évolution des profils métaboliques foliaires selon le stade d’infection, confirmant le potentiel de cette approche pour le développement d’outils de diagnostic. Les résultats indiquent également une réponse métabolique à l’infection qui dépend de la variété.
Impact pour la chaire Sharka
Les travaux de Faustine, Destan et Chloé renforcent significativement la capacité à détecter précocement la sharka.
La base de données créée et les protocoles développés constituent une ressource exploitable pour identifier des biomarqueurs robustes, essentiels au diagnostic précoce de la maladie.